Для асептического сбора проб воды с определенных горизонтов используют специальные устройства.
Они заимствованы из практики гидрологов и главным образом микробиологов. Для этих целей было предложено около сотни различных моделей пробоотборников. Основным принципом их устройства является то, что под воду погружается предварительно простерилизованный сосуд, герметически закрытый пробкой с запаянной капиллярной трубкой, которая разбивается на нужной глубине, и вода проникает в сосуд. На обратном пути сосуд идет открытым, что ставит под сомнение асептичность отбора пробы воды.
По такому принципу устроены приборы, предложенные Зобеллом, Сибуртом с сотр. Нискиным, а также пробоотборник Кобет-Вейланда. По другому принципу устроены батометры Нансена и Ван-Дорна: они идут вниз открытыми, а вверх поднимают полностью изолированную пробу воды. Эти батометры нашли очень широкое применение в практике морских микробиологических исследований.
Каждый из пробоотборников имеет свои преимущества н недостатки.
Для микологических исследований были использованы некоторые из упомянутых выше приборов. Так, Шнейдер работал в Балтийском море с прибором Зобелла. Пробоотборник Нискина использовали Мейерс с сотр. на Черном море и Рот с сотр. — и субтропической Атлантике. Батометр Ван-Дорна применен в этой же экспедиции Рота, а также Стилом.
С батометром Нансена работал в северной Атлантике и в Северном морс Хёнк, а в Белом море Артемчук.
Наибольшее количество микологических исследований выполнено при использовании пробоотборника Кобет-Вейланда.
Пробы с поверхности воды обычно брали различными стерильными склянками. Микробиологи предложили несколько конструкций приборов для обеспечения максимальной стерильности при получении проб самого верхнего слоя воды — 150—200 мк и 0—2 см. Однако эти приборы пока ещё не были использованы в морской микологии.
Для изучения микофлоры пены образцы ее собирают в большие пластиковые мешки, в которые попадает вода, а пена собирается над водой. Пену выдавливают в бутылку, а воду отбрасывают.
Преобладающая часть исследований микофлоры морских грунтов проведена в прибрежной зоне (песчаные пляжи, илы с мелководья, побережье, заливаемое при приливе, дюны), где вполне применимы методы почвенной микологии. Кстати, ни в одной из этих работ не упоминается о способах отбора проб, за исключением статьи Сипмана.
При изучении грибов грунтов из сублиторали, шельфа и абиссали необходимо применение специальных приспособлений для поднятия образцов. На небольших глубинах, до нескольких метров, можно использовать драги. В эстуарии на побережье Северной Каролины применена драга Экмана, предварительно обработанная 5%-ным формалином или 95%-ным спиртом. В опыте использовали грунт только средней (не соприкасающейся со стенками драги) части пробы и сразу переносили ее стерильным шпателем в стерильную посуду.
На больших глубинах грунт, обычно отбирают дночерпателями (Ваdeng reifer) различных систем. Наиболее широко в микологической практике применяли дночерпатель Ван Вина. Кроме того, могут быть использованы дночерпатель Петерсена, дночерпатель «Orange-peal» (идет вглубь в закрытом виде), а также маленький дночерпатель Экманна. Подробные описания этих приборов и рекомендаций к использованию даны Хёнком и Вудом. В Советском Союзе для подобных работ применяют дночерпатель «Океан-50».
Для количественных исследований, особенно на более низких горизонтах, отбор грунтов производят, применяя различные трубки: аппарат Мора и Нила и пробоотборник Пратье.
Ряд исследователей при изучении грибов в грунтах применяли пробоотборник Рейнека.
Установить преимущества какого-либо из описанных приборов, по данным разных авторов, не представляется возможным, так как они весьма кратки, а иногда они совсем не приводят подробных описаний самих приборов и способа их использования. К тому же пока еще никто не проводил параллельного отбора проб разными орудиями.
Микологический анализ воды и грунта дает нам представление о сапротрофной микофлоре морских водоемов. Как уже упоминалось, довольно значительное число сапротрофных морских грибов было описано на водорослях, высших растениях и даже на бентосных животных.
В работах, посвященных грибным паразитам бентосных беспозвоночных, авторы не приводят никаких указаний о сохранении в лабораторных условиях животных. Скорее всего запас необходимых животных пополняли за счет отлова новых особей в море.
